ATAC-seq通过使用过度活跃的Tn5转座酶探测开放染色质来识别可访问的DNA区域，该转座酶将测序适配器插入基因组的开放区域。 然后，测序读数可用于推断染色质可及性增加的区域，以 …

ATAC-seq是什么？ 在真核生物细胞中，DNA复制或转录时，反式作用因子会与开放染色质区域的顺式作用元件（如启动子，增强子，绝缘子，沉默子等）结合，进而调控细胞基因表达。

ATAC-seq（Assay for Transposase – Accessible Chromatin with highthroughput sequencing），通过Tn5转座酶将测序接头插入染色质的开放区域，然后通过测序数据来推断 …

转座酶可及染色质测序分析（ATAC-seq）是常见的研究染色质可及性的方法，ATAC-seq联合RNA-seq是一种新的研究思路，为阐述基因组和特定生物过程中的基因差异表达提供见解。然 …

Oct 24, 2022 · 研究通过 ATAC-seq 与 RNA-seq 绘制了恒河猴大脑的解剖学综合转录组图谱和大脑皮层的染色质可及性图谱。 首先对恒河猴大脑52个区域的416个样本进行了RNA测序（RNA …

ATAC-seq-TSS富集图-deeptools-学习笔记 1.安装deeptools conda activate conda create --name deeptools-room source activate deeptools-room pip install deeptools 2.这里仅针对一个bam做 …

Mar 14, 2024 · 知乎，中文互联网高质量的问答社区和创作者聚集的原创内容平台，于 2011 年 1 月正式上线，以「让人们更好的分享知识、经验和见解，找到自己的解答」为品牌使命。知乎 …

我们知道这些核小体的分布在染色质的有一些地方是致密的有一些是疏松的，而疏松的地方会空出很多裸露的片段，这些裸露的片段恰恰就是转录发生的地方，也就是我们所谓的开放区域，这 …

ATAC-Seq实验仅需要约50,000个细胞作为起始样本，且实验步骤相对较为简单，是开始表观遗传研究的一种非常高效的方法。 ATAC-Seq 实验原理在ATAC-seq试验中，细胞或组织样本在核 …

CUT&Tag完全颠覆传统ChIP-seq（染色质免疫沉淀-测序）的操作流程，它能够高效、准确地检测细胞中的蛋白质与DNA之间的相互作用。 CUT&Tag 相比传统的ChIP-seq技术，CUT&Tag技 …