外显子(Exon)：DNA链或前体mRNA上能够编码蛋白质的核苷酸片段. 由DNA转录后先形成前体mRNA(pre-mRNA),这些未成熟的mRNA需要经过一定的加工，如剪接，去除内含子5'端加一个7-甲基鸟苷酸“帽子”，3'端加上一个多聚腺苷酸尾. 最后形成较短的有功能的成熟mRNA。

至于lncRNA的exon是根据大家默认的剪切位点来预测的，因为我们认为lncRNA也是完整的基因元件，也存在splice junction，所以按照mRNA的那一套来预测lncRNA的exon，但不代表这些exon可以编码蛋白。不过某些lncRNA确实可以编码一些小肽喔~

我用hisat2-build 建索引，如果添加--ss和--exon参数，就会提示is not reverse-deterministic, so revers…

最左侧上面exon选项，搜索就能够看到ENSE00003793906属于Transcript: SCN1A-212 ENST00000636194.1转录本的28号外显子。 发布于 2017-10-26 12:59 赞同 添加评论

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