Dec 22, 2016 · OTU（operational taxonomic units），即操作分类单元。 通过一定的距离度量方法计算两两不同序列之间的距离度量或相似性，继而设置特定的分类阈值，获得同一阈值下的距离矩阵，进行聚类操作，形成不同的分类单元。

一、otu聚类 1.1 为何要进行otu聚类a) 测序完成后，每例样品的测序序列达到几万条，对每一条序列当然都可以进行物种注释，但这种方式工作量大，毕竟每一条序列均需要与数据库进行比对、比对过程又比较耗时，而且扩…

An operational taxonomic unit (OTU) is an operational definition used to classify groups of closely related individuals. The term was originally introduced in 1963 by Robert R. Sokal and Peter H. A. Sneath in the context of numerical taxonomy , where an "operational taxonomic unit" is simply the group of organisms currently being studied. [ 1 ]

May 28, 2018 · OTU（operational taxonomic units），即操作分类单元。 通过一定的距离度量方法计算两两不同序列之间的距离度量或相似性，继而设置特定的分类阈值，获得同一阈值下的距离矩阵，进行聚类

什么是otu？ 为什么会出现这个概念呢？ 菌群多样性分析是通过二代测序技术对微生物基因组中的 marker基因 （细菌为 16S序列 ，真菌为18S或 ITS序列 ）全长区段或部分区段进行测序从而得到环境样本中微生物种类和丰度信息的，原则上我们把测序得到的序列与 ...

May 2, 2017 · OTU（Operational Taxonomic Unit ）即分类操作单元，是在系统发生学研究或群体遗传学研究中，为了便于进行分析，人为给某一个分类单元（品系，种，属，分组等）设置的同一标志。

OTU（Operational Taxonomic Units，操作分类单元）是过去在微生物群落多样性研究中非常重要的一个概念，是一种将复杂测序数据降维成简单数据的做法。 通常按照97%的相似性阈值将序列聚类为不同的 OTU，每一个OTU通常被视为一个微生物物种。

什么是OTU. OTU(operational taxonomic units) 是在系统发生学研究或群体遗传学研究中，为了便于进行分析，人为给某一个分类单元（品系，种，属，分组等）设置的同一标志。通常按照 97% 的相似性阈值将序列划分为不同的 OTU，每一个 OTU 通常被视为一个微生物物种。

种下单元（operational taxonomic unit，简称OTU）是指生物多样性科学中对种群进行分类和研究的基本单元，它可以是一个物种的个体、种群或者亚种等级的组成部分。

1.定义：OTU（operational taxonomic unit）是基于序列相似性进行划分的操作分类单元。 它将相似度达到一定阈值的序列归为一个OTU，可以是种、属、科等不同的分类水平。