
IGV和Adobe AI制作RIP-seq Peak图简易教程|m6A专题 - 知乎
Feb 4, 2016 · 做完了RIP-seq、 ATAC-seq 、 m6A-seq 等项目,想对基因的某个区域高富集区域绘制peak calling的图,类似于下面展示的几种形式,你会用什么软件呢? 当然这里的AI不是 …
m6A、ATAC等表观文章中的peak可视化图形如何实现? - 知乎
要绘制peak峰图需要用到一款软件—IGV(Integrative Genomics Viewer),这是一款基于java的免费软件,可对基因组各类数据进行整合与可视化,软件官网还贴心地为科研人提供 …
IGV——基因组可视化:高阶教程 - CSDN博客
Oct 4, 2024 · IGV(Integrative Genomics Viewer)是一个高性能的可视化工具,可以交互式的察看综合的基因组相关数据,友好的支持多种数据类型,包括芯片、二代测序和基因组注释数据 …
超详细图文版:如何实现m6A测序数据可视化?-云序生物
m6A或其他修饰MeRIP测序之后经常会需要通过一种“可视化”方法,直观考察以及展示到文章中个别基因或区域的测序原始信号(coverage)和序列比对情况,即展示甲基化峰。 类似的可视 …
超详细图文版:如何实现m6A测序数据可视化?
**为大家逐步详细介绍用IGV软件进行甲基化峰可视化的操作方法,其中也囊括了一些常见问题的解答 。 m6A或其他修饰 MeRIP测序 之后经常会需要通过一种“可视化”方法,直观考察以及展 …
玩转基因组浏览器之利用IGV查找motif结合位点 - 腾讯云
May 7, 2020 · motif在基因组上结合位点的查找是生信分析中的一项基本技能,在转录因子的chip_seq, m6A_seq等落雨都有广泛应用,之前也写了很多的文章来介绍motif. 本文以最近非常 …
IGV、Tablet、Samtools——比对可视化怎么做? - 知乎专栏
IGV是目前最常用的基因组可视化软件,它的全名叫做Integrative Genomics Viewer,从名字上我们就可以看到这是一款为了基因组学数据可视化而开发的软件。 IGV诞生于2011年,由大名 …
RIP-seq让m6A后期研究威力加倍 | RIP专题 - 搜狐
May 21, 2020 · 陈建军课题组在本文中,先利用生物素Biotin的RNA探针(具有带m6A修饰的GGACU)进行RNA pulldown,鉴定到了一类新型的RNA结合蛋白IGF2BP1/2/3。 接下来还利 …
使用igv手把手教你读懂、理解m6a 、chip-seq等表观数据的peaks …
对,能够能够拉到cdk4,同时在cdk4这个地方,它是有这个m6a修饰的。 对是对吧,所以这两个测序技术它就能够结合起来。 对,第第一个第二个。
孟佳课题组|m6A数据Peak识别软件exomePeak2使用指北 - 简书
Mar 10, 2021 · 使用示例结果中的一个差异peak在IGV中查看peak分布. 相对于exomePeak,作者还输出了每个peak在每个样本中的read count数,就用第一个peak示例吧,差异FC比较大,p …