
IGV和Adobe AI制作RIP-seq Peak图简易教程|m6A专题 - 知乎
Feb 4, 2016 · 做完了RIP-seq、 ATAC-seq 、 m6A-seq 等项目,想对基因的某个区域高富集区域绘制peak calling的图,类似于下面展示的几种形式,你会用什么软件呢? 当然这里的AI不是 …
Transcriptome-Wide m6A Methylome and m6A-Modified Gene …
Here, we performed two high-throughput sequencing methods, methylated RNA immunoprecipitation sequencing (MeRIP-seq), and RNA sequencing (RNA-seq) to identify key …
m6A、ATAC等表观文章中的peak可视化图形如何实现? - 知乎
要绘制peak峰图需要用到一款软件—IGV(Integrative Genomics Viewer),这是一款基于java的免费软件,可对基因组各类数据进行整合与可视化,软件官网还贴心地为科研人提供 …
玩转基因组浏览器之利用IGV查找motif结合位点 - 腾讯云
May 7, 2020 · motif在基因组上结合位点的查找是生信分析中的一项基本技能,在转录因子的chip_seq, m6A_seq等落雨都有广泛应用,之前也写了很多的文章来介绍motif. 本文以最近非常 …
超详细图文版:如何实现m6A测序数据可视化?
m6A或其他修饰MeRIP测序之后经常会需要通过一种“可视化”方法,直观考察以及展示到文章中个别基因或区域的测序原始信号(coverage)和序列比对情况,即展示甲基化峰。 类似的可视 …
IGV——基因组可视化:高阶教程_igv可视化-CSDN博客
Oct 4, 2024 · IGV 支持芯片数据,NGS 数据,基因组注释等多种类型的数据,各种类型的信息以行为单位进行展示,称为 track,不同类型的 数据可视化 方式不同。 官 …
超详细图文版:如何实现m6A测序数据可视化?-云序生物
m6A或其他修饰MeRIP测序之后经常会需要通过一种“可视化”方法,直观考察以及展示到文章中个别基因或区域的测序原始信号(coverage)和序列比对情况,即展示甲基化峰。 类似的可视 …
RIP-seq让m6A后期研究威力加倍 | RIP专题_蛋白 - 搜狐
May 21, 2020 · 陈建军课题组在本文中,先利用生物素Biotin的RNA探针(具有带m6A修饰的GGACU)进行RNA pulldown,鉴定到了一类新型的RNA结合蛋白IGF2BP1/2/3。 接下来还利 …
使用igv手把手教你读懂、理解m6a 、chip-seq等表观数据的peaks …
Feb 23, 2024 · 哦,那怎么知道是哪一个转录本上,它那个M6A那个峰值有差异呢老师。 所以你看啊,我们你还记得我让你看那个文献里面啊。
孟佳课题组|m6A数据Peak识别软件exomePeak2使用指北 - 简书
Mar 10, 2021 · 使用示例结果中的一个差异peak在IGV中查看peak分布 相对于exomePeak,作者还输出了每个peak在每个样本中的read count数,就用第一个peak示例吧,差异FC比较大,p值 …